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Weblog della Biblioteca Medica "PINALI" Università degli Studi di Padova

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Posts Tagged ‘banca dati’

CCRIS – Chemical Carcinogenesis Research Information System.

Posted by giorgiobertin su aprile 2, 2017

CCRIS acronimo per Chemical Carcinogenesis Research Information System, è l’archivio di dati tossicologici nel Toxicology Data Network (TOXNET) della National Library of Medicine (NLM), sviluppato e gestito dal National Cancer Institute (NCI).

CCRIS

Contiene record chimici con risultati di test di carcinogenicità, mutagenicità, stimolazione e inibizione tumorale.

I dati provengono da studi citati in riviste primarie e strumenti di aggiornamento correnti, rapporti del National Cancer Institute e altre fonti speciali. I risultati dei test sono sottoposti alla verifica di esperti del settore.

La ricerca può essere fatta cercando il nome della sostanza, nome del frammento chimico, Chemical Abstracts Service Registry Number (RN).

Accedi al database: CCRIS

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CIViC: Database online sulle mutazioni genetiche del cancro.

Posted by giorgiobertin su gennaio 30, 2017

I ricercatori della Washington University School of Medicine di St. Louis hanno sviluppato un  “knowledge base” online destinato alla raccolta e l’organizzazione di informazioni sulla genetica del cancro. La speranza è questa “Wikipedia” della genomica del cancro aiuterà i medici a sviluppare terapie mediche di precisione per i pazienti con il cancro. Il database dovrebbe offrire la possibilità di identificare mutazioni importanti nel tumore di un paziente e potenzialmente il collegamento ad eventuali farmaci noti per correggere errori genetici.

Civic
A schematic illustrates how a shared knowledgebase can help alleviate the bottleneck caused by the sheer quantity of raw sequencing data.Credit: Image courtesy of Washington University School of Medicine

Siamo impegnati a mantenere questa risorsa aperta e disponibile a chiunque voglia contribuire o fare uso di queste preziose informazioni“, ha detto Malachia Griffith, professore di medicina. “Vorremmo che fosse un esercizio di comunità ed una risorsa pubblica. Le informazioni sono di dominio pubblico. Non ci sono restrizioni sul loro utilizzo, accademico o commerciale.

All’interno del database denominato “CIViC” sono inserite le descrizioni di rilevanza clinica di 732 mutazioni da 285 geni per 203 tipi di cancro, tutte raccolte da rivedere 1.090 pubblicazioni scientifiche e mediche.

La descrizione e le caratteristiche del database sono state pubblicate in un articolo sulla rivista “Nature Genetics“.

Leggi abstract dell’articolo:
CIViC is a community knowledgebase for expert-crowdsourcing the clinical interpretation of variants in cancer.
Griffith M*, Spies NC*, Krysiak K*, McMichael JF, Coffman AC, Danos AM, Ainscough BJ,………Wartman LD, Wilson RK, Mardis ER, Griffith OL
Nature Genetics. Jan. 30, 2017.

Accedi al database:
CIViC

CIViC: A knowledgebase for expertcrowdsourcing the clinical interpretation of variants in cancer – Slide

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EFSA: Glossario dei termini scientifici.

Posted by giorgiobertin su giugno 7, 2016

E’ stato pubblicato dall’EFSA (European Food Safety Authority) il glossario con oltre 250 termini scientifici. Il glossario apporterà maggior chiarezza nella comunicazione EFSA destinata al grande pubblico, aiutando chi è interessato a capire alcuni dei concetti scientifici più complessi.

EFSA-logo

Il glossario è disponibile in inglese, francese, tedesco e italiano sotto forma di elenco alfabetico. Nel tempo verrà gradualmente integrato nei nostri comunicati e articoli di approfondimento, in modo che ogni volta che si utilizza un termine per il quale è stata creata una definizione, si aprirà un pop-up dove si potrà approfondire il concetto. Per esempio: dose giornaliera ammissibile o assunzione adeguata.

Accedi al glossario: http://www.efsa.europa.eu/it/glossary-taxonomy-terms

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FDA Approved Animal Drug Products.

Posted by giorgiobertin su marzo 7, 2016

FDA Approved Animal Drug Products Online Database System è un database reso disponibile dal Il VMRCVM Drug Information Laboratory del Virginia-Maryland Regional College of Veterinary Medicine.

Animal_Drugs_FDA

Il database fattuale della FDA (FDA Center for Veterinary Medicine) fornisce dati e informazioni sui farmaci per gli animali approvati e non approvati e altri dati correlati. Il database permette di consultare anche gli aggiornamenti mensili al Green Book (repertorio di farmaci per gli animali) dal 1989 a oggi.

Accedi al Database: FDA Approved Animal Drug Products Online Database System

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Il futuro delle informazioni sui farmaci: PDR mobile app.

Posted by giorgiobertin su gennaio 19, 2016

Il Physicians ‘Desk Reference® (PDR) è una risorsa vitale per le informazioni sui farmaci. Ora La piattaforma PDR si è dotata di una versione mobile (mobile PDR) progettata per fornire agli operatori sanitari tutte le informazioni sui farmaci direttamente sul cellulare in qualsiasi momento e in qualsiasi luogo.

mobilePDR PDR_image  Drug_comparison

Le informazioni sono accessibili dalla schermata principale dell’app,  basta inserire il nome di un farmaco, o la classe farmacologica.  E’ possibile selezionare più farmaci e confrontare le loro caratteristiche  per determinare le migliori opzioni terapeutiche per i pazienti. Scorrendo da sinistra a destra si trovano: il dosaggio, le indicazioni, gli effetti collaterali, e altre informazioni chiave.

Scarica le apps:

AppStore    GooglePlay

Fonte ed approfondimenti: http://www.pdr.net/

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New York Public Library: immagini e documenti free.

Posted by giorgiobertin su gennaio 9, 2016

La New York Public Library rende ora possibile scaricare gratuitamente oltre 180 mila documenti tra mappe, manifesti, manoscritti, spartiti, disegni, fotografie, lettere, testi antichi messo a disposizione del pubblico in versione digitale.
Tutti gli elementi sono ad alta risoluzione disponibili direttamente dal sito Digital Collections.


The New York Public Library just uploaded nearly 200,000 images you can use for free

Un tesoro di immagini e documenti che è possibile condividere, scaricare, stampare senza nessun permesso e nessuna restrizione sull’uso. La visualizzazione di tutti i materiali è possibile ordinarla per data, genere, raccolta e anche colore.

Accedi alla collezione: sito Digital Collections
Fonte: New York Public Library

Explore what’s in the public domain with our visualization tool.

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GEneSTATION: un database sulla genetica della gravidanza e riproduzione.

Posted by giorgiobertin su dicembre 4, 2015

GEneSTATION è un database delle conoscenze attuali sulla genomica evolutiva e funzionale della gravidanza. Obiettivo: capire meglio le basi genetiche di complicanze come il parto pretermine.

logoGEMSTATION

La piattaforma – che è accessibile ai ricercatori di tutto il mondo e può essere via via arricchita di nuovi contenuti – non si limita a ospitare e integrare dati derivati da studi sugli esseri umani: dalla pagina Organismi si accede a dati e informazioni relativi ad altri 24 mammiferi (gatto, babbuino, coniglio, macaco, ornitorinco, solo per citarne alcuni), per poter condurre confronti in un’ottica evolutiva.

Accedi al database: GEneSTATION

Fonte: Oggiscienza.it

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NeuroElectro: enciclopedia dei neuroni.

Posted by giorgiobertin su aprile 7, 2015

E’ disponibile online un nuovo strumento sviluppato dai ricercatori della Carnegie Mellon University che raccoglie tutte le informazioni disponibili sui diversi tipi di neuroni del cervello.

Il nuovo portale “www.neuroelectro.org” è stato presentato in un articolo sulla rivista “Journal of Neurophysiology“. Nell’archivio vengono descritte 100 differenti tipi di cellule e 10mila articoli scientifici che presentano la descrizione fisiologica e funzionale di come i neuroni rispondono a stimoli di vario tipo.
Se vogliamo arrivare a ricostruire o modificare il cervello, dobbiamo prima conoscere i pezzi con cui stiamo lavorando“, spiega Nathan Urban, della Carnegie Mellon University.

Ricordiamo che esiste un’altro database pubblico l’Allen Brain Atlas che contiene la descrizione dell’espressione genica dei neuroni nei topi.

Leggi il full text dell’articolo:
Brain-wide analysis of electrophysiological diversity yields novel categorization of mammalian neuron types
Shreejoy J Tripathy , Shawn D. Burton , Matthew Geramita , Richard C. Gerkin , Nathaniel N. Urban
Journal of Neurophysiology Published 25 March 2015 , DOI: 10.1152/jn.00237.2015

Accedi al portale: http://www.neuroelectro.org/

Fonte: Carnegie Mellon University

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ThatMorning: la mappa dei migliori ospedali d’Italia.

Posted by giorgiobertin su febbraio 5, 2015

Thatmorning” è una una piattaforma nata con l’intenzione di orientare le scelte in materia di cure e terapie. E’ il Tripadvisor esportato nella sanità, è un portale che cerca di disegnare una mappa dei migliori ospedali d’Italia, reparto per reparto, incrociando due tipi di dati differenti: valutazioni provenienti dal campo scientifico e impressioni e commenti raccolti tra i pazienti.

Il portale fornisce una fotografia di 1.200 ospedali e 8.500 reparti, tutte strutture pubbliche o convenzionate. All’interno anche un’area personalizzata per memorizzare note sulla propria salute (ma non solo), inserire anche copie digitali degli esami ed averli sempre a disposizione.

Accedi al portale: thatMorning.com

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Database of Antiretroviral Drug Interactions.

Posted by giorgiobertin su febbraio 1, 2015

Database of Antiretroviral Drug Interactions” è database gratuito che contiene informazioni sulle interazioni tra farmaci (che coinvolgono almeno un farmaco antiretrovirale) che i compilatori della risorsa hanno trovato nella letteratura medica, negli abstract delle conferenze di maggiore rilevanza scientifica o nelle informazioni della Food and Drug Administration (USA). Nella pagina del database sono presenti link ad altre informazioni contenute nel portale HIV Insite.

Database of Antiretroviral Drug Interactions

Accedi alla risorsa: Database of Antiretroviral Drug Interactions

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Dietary Supplement Label Database.

Posted by giorgiobertin su gennaio 26, 2015

Dietary Supplement Label Database (DSLD) è un progetto congiunto di: Office of Dietary Supplements (ODS) e National Library of Medicine (NLM), del National Institutes of Health (NIH).
DSLD è uno strumento informativo e di ricerca utile a ricercatori, accademici, professionisti del settore della salute e al pubblico.

dsld database

Al suo interno sono contenuti: informazioni su supplementi dietetici e nutrizionali (e integratori) presenti nel mercato USA, informazioni su prodotti non più commercializzati, dati aggiornati tratti dal National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) dietary supplements database, strumenti per la comparazione dei nutrienti e la valutazione del valore nutrizionale complessivo con lo Dietary Reference Intake (DRI), valutati anche in rapporto a gruppo di età/genere/stile di vita.

Accedi alla risorsa: Dietary Supplement Label Database

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Genecards: Database di geni umani.

Posted by giorgiobertin su gennaio 25, 2015

GeneCards è un database di geni umani che fornisce informazioni complete ed  aggiornate su tutti i geni umani noti e previsti.

GeneCards

GeneCards estrae ed integra dati genetici relativi, tra cui genomica, trascrittomica, proteomica, genetica, con  le informazioni funzionali e cliniche. Tutto questo viene estratto automaticamente da oltre 100 fonti web accuratamente selezionate, consentendo in tal modo un accesso one-stop per una informazione di base molto ampia.

GeneCards supera le barriere del formato dei dati e l’eterogeneità, e utilizza la nomenclatura standard ed i simboli dei geni. Presenta un ricca sottoinsieme di dati per ogni gene, e fornisce i link profondi alle fonti originali per un ulteriore esame. GeneCards è ampiamente utilizzato, e assiste nella comprensione degli aspetti genetici legati della biologia e della medicina.

Accedi al Database: GeneCards

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ILISI: Letteratura Italiana di Scienze Infermieristiche.

Posted by giorgiobertin su gennaio 21, 2015

ILISI  è una banca dati bibliografica per infermieri, che permette di ricercare e consultare le schede bibliografiche degli articoli pubblicati nelle principali riviste infermieristiche e d’interesse infermieristico in Italia, tramite ricerca per categorie, parole chiave o libere. I risultati sono corredati da abstract.

ILISI Indice della Letteratura Italiana di Scienze Infermieristiche

Accedi alla risorsa: ILISI 

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Hand Press Book Database.

Posted by giorgiobertin su gennaio 18, 2015

Hand Press Book Database è un database bibliografico che permette agli studiosi di tutte le discipline un accesso simultaneo a oltre 2.773.600 records del patrimonio a stampa europeo dalle sue origini fino al 1830. Il numero dei records è in costante crescita : i dati vengono forniti dalle biblioteche appartenenti al Consortium of European Research Libraries (CERL), una associazione di 60 importanti istituti di 16 nazioni e sono distribuiti attraverso OCLC-FirstSearch service.Per l’Italia sono presenti: Regione Toscana, Servicio Biblioteche, Musei e Attività Culturali e Istituto Centrale per il Catalogo Unico (ICCU).

HPB- database

Accedi alla risorsa: Hand Press Book Database

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Population Index: Banca dati demografica.

Posted by giorgiobertin su gennaio 18, 2015

Population Index è una banca dati bibliografica di demografia, consultabile gratuitamente dal sito Web della Princeton University. E’ il principale strumento, a livello mondiale, di ricerca bibliografica in tema di popolazione. Il sito fornisce oltre 40mila estratti di letteratura demografica che copre tutti i settori di interesse per gli studiosi di popolazione: fecondità, mortalità, crescita demografica, famiglia, demografia storica. Copertura temporale: 1986-2000.

piw

Accedi alla risorsa: Population Index

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PharmGKB: Pharmacogenetics and Pharmacogenomics Database.

Posted by giorgiobertin su gennaio 17, 2015

PharmGKB è una risorsa pubblica gratuita. E’ stata creata con il contributo del National Institute of Health (NIH) e fa parte del progetto NIH Pharmacogenetics Research Network (PGRN). L’ obiettivo di PharmGKB è di aiutare i ricercatori nello studio dell’ effetto delle variazioni genetiche individuali sulla diversa risposta ai farmaci.

pharmgkb

Accedi alla risorsa:  PharmGKB

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PEDro: Banca dati di Fisioterapia.

Posted by giorgiobertin su gennaio 11, 2015

PEDro (Physiotherapy Evidence Database) è un’iniziativa del Centre for Evidence Based Physiotherapy dell’Università di Sydney. E’ una banca dati gratuita di fisioterapia di evidenza. Permette un rapido accesso a dettagli bibliografici e abstracts di sperimentazioni cliniche randomizzate (randomized clinical trials) e reviews sistematiche in fisioterapia. Permette anche l’accesso ai full-text, se forniti dall’editore.

Physiotherapy Evidence Database, PEDro

Accedi alla risorsa: PEDro

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SantePsy: Banca bibliografica di psichiatria e Salute mentale.

Posted by giorgiobertin su gennaio 11, 2015

SantéPsy è una base dati bibliografica in lingua francese specializzata in psichiatria e salute mentale (informazioni a partire dal 1970). Contiene informazioni tratte da riviste, tesi, testi ufficiali, relazioni e pubblicazioni di discipline quali: psichiatria, psicologia, psicanalisi, cure infermieristiche, gestione amministrativa ed ospedaliera, diritto alla salute, dipendenza da droghe. E’ possibile trovare informazioni essenziali tratte da testi ufficiali di psichiatria e salute mentale, abrogati o in vigore.

Base SantéPsy

Accedi alla banca dati: SantéPsy

 

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Pharmaceutical Substances: Banca dati sui composti farmaceutici.

Posted by giorgiobertin su gennaio 10, 2015

Pharmaceutical Substances è una guida bibliografica completa a ogni composto farmaceutico. Il database contiene informazioni complete su più di 2400 sostanze che sono o sono state in commercio. La base dati è un utile punto partenza non solo per gli specialisti della chimica dei farmaci, ma anche per tutti coloro che si interessano della sintesi o dell’uso di sostanze farmaceutiche. Pharmaceutical Substances mette in correlazione e crea dei link tra nomi comuni e nomi generici, strutture, processi di produzione/isolamento, brevetti e letteratura, usi medici e informazioni commerciali.

psheader

Accedi alla banca dati: Pharmaceutical Substances

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JSTOR: Journal Storage Project.

Posted by giorgiobertin su agosto 9, 2014

JSTOR (abbreviazione di Journal Storage) è una biblioteca digitale statunitense fondata nel 1995, che contiene i numeri arretrati di oltre 2.000 riviste accademiche e professionali che abbracciano 50 discipline, ci sono inoltre alcuni degli articoli più autorevoli e più letti nel campo delle arti e delle scienze. Il contenuto eccezionale è stato conservato nella sua forma originale ed è disponibile in formato digitale di altissima qualità.

jstor-logo

La costruzione dell’archivio ha lo scopo di promuovere l’accesso, la fruibilità e la conservazione su supporto digitale. I contenuti dei periodici in JSTOR  pubblicati prima del 1870 (per l’Europa e dal 1923 per gli Stati Uniti) sono accessibili gratuitamente per tutti gli utenti.

Accedi alla Biblioteca digitale: JSTOR

Lista dei periodici presenti su JSTOR

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AIFA: nuova banca dati sui farmaci.

Posted by giorgiobertin su novembre 14, 2013

E’ online la Banca Dati dei farmaci, il primo database ufficiale in Italia sui medicinali, che al momento contiene oltre 16.000 documenti aggiornati e autorizzati dall’Aifa e dall’Agenzia Europea dei Medicinali (Ema) e informazioni su oltre 66.400 confezioni autorizzate.

aifa-farmaci

La nascita della Banca Dati dei Farmaci rappresenta un ulteriore fondamentale passo verso la costruzione di un unico, dinamico e integrato database del farmaco che l’Agenzia sta realizzando”, ha spiegato il direttore dell’Aifa Luca Pani, durante la presentazione.
Il database permette di effettuare ricerche per nome commerciale, principio attivo, nome dell’Azienda.
Per ogni farmaco è disponibile il foglietto illustrativo, la scheda di autorizzazione al commercio, le caratteristiche del prodotto.

Accedi alla banca dati: https://farmaci.aifa.gov.it.

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Un database di geni per potenziali terapie farmacologiche.

Posted by giorgiobertin su ottobre 14, 2013

I ricercatori della Washington University School of Medicine  a St. Louis, hanno creato un enorme database online (DGIdb) contenente migliaia di geni legati al cancro e altre malattie, in associati ai farmaci. Alcuni dei farmaci sono approvati dalla US Food and Drug Administration, mentre altri sono in sperimentazione clinica o semplicemente si trovano nella pipeline di sviluppo di nuovi prodotti.

dgidb

Abbiamo voluto creare un database completo che sia facile da usare, qualcosa sulla falsariga di un motore di ricerca di Google per geni associati alla malattia”, ha spiegato Malachia Griffith, uno degli auori.

Ci sono voluti diversi anni per sviluppare la banca dati, ora è disponibile al pubblico gratuitamente. Esso comprende più di 14.000 interazioni farmaco-gene che coinvolgono 2.600 geni e 6.300 farmaci che colpiscono i geni. Altri 6.700 geni sono nel database, perché potenzialmente potrebbero essere mirati con farmaci futuri.

I dettagli del database di interazione gene  – farmaco sono segnalati on-line in un articolo pubblicato su “Nature Methods“. La banca dati è orientata verso i geni del cancro, ma include geni coinvolti nella malattia di Alzheimer, malattie cardiache, diabete e molte altre malattie. I ricercatori avvertono che il database è destinato a scopi di ricerca e che non consiglia trattamenti. Lo scopo principale del database è quello di promuovere la ricerca clinica al fine di curare le malattie in modo più efficace.

Accedi al database: DGIdb

Leggi abstract:
DGIdb: mining the druggable genome
Malachi Griffith, Obi L Griffith,Adam C Coffman,James V Weible,Josh F McMichael,+ et al.
Nature Methods doi:10.1038/nmeth.2689 Published online 13 October 2013

Fonte: Washington University School of Medicine

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VideoF@r: banca dati italiana sul consumo dei farmaci.

Posted by giorgiobertin su luglio 7, 2013

L’applicazione VideoFar, consultabile su Epicentro e presentata durante il convegno “L’uso dei farmaci in Italia dal 2000 ad oggi: tra sostenibilità e innovazione possibile” (organizzato a Roma per il 4 luglio 2013), rende disponibili i dati di consumo dei farmaci in Italia, nel periodo 2000-2011 consentendone, inoltre, la libera elaborazione.

videofar

La banca dati sui farmaci offre la possibilità di analizzare i volumi di diverse classi di farmaci nel tempo e per Regione, consentendo di avere una visione rapida delle dinamiche prescrittive nell’arco di oltre un decennio. Videofar, non è un nome scelto a caso ma vuole richiamare un progetto del Cnesps-Iss che presentava, oltre venti anni fa, un sistema innovativo per l’Italia e nel contesto internazionale, per condurre studi descrittivi e analitici sui farmaci utilizzando i sistemi di monitoraggio delle prescrizioni.

Accedi alla banca dati: VideoF@ar

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Cases Database: una banca dati sui casi clinici.

Posted by giorgiobertin su dicembre 11, 2012

Documentare l’anamnesi di un paziente e informare i medici su come il paziente è stato valutato e la progressione  della sua malattia è forse il più antico metodo di comunicazione delle prove mediche. Nel 21° secolo queste relazioni continuano ad essere e a svolgere un ruolo importante.

Cases_database

Per rafforzare questa rete comunicativa, è stata sviluppata una nuova risorsa preziosa – Cases Database, una banca dati in continuo aggiornamento, liberamente accessibile con oltre 11.000 casi clinici provenienti dalle pubblicazioni di oltre 10o giornali di grossi editori tra cui Springer, BMJ e PubMed Central.

Il database prevede la ricerca per parola e l’utilizzo di filtri (anno, età, rivista, interventi, sintomi, paese,..) nella sezione “cases”.

Accedi al database:
Cases Database

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Da Nature nuova rivista e database open access.

Posted by giorgiobertin su dicembre 9, 2012

Clinical & Translational Immunology è una nuova rivista ad accesso aperto che cerca di coprire tutti gli aspetti della immunologia umana di base, studi traslazionali e clinici, tra cui modelli sperimentali specifici per le malattie umane.

cti_cimage

La rivista, edita da Nature.com, ha richiesto la quotazione per un Impact Factor, ed è indicizzata da Google Scholar.

Da Nature Publishing Group, segnaliamo “Antibodypedia” una banca dati online ad accesso aperto su 500.000 anticorpi, che copre prodotti genici codificati da 17.892 geni (circa l’88% di tutti i geni umani). Il sito fornisce dati sull’efficacia degli anticorpi in una gamma di tecniche biologiche e biochimiche delle cellule – permette di trovare l’anticorpo giusto per la giusta applicazione.

Accedi alla rivista:
Clinical Translational Immunology

Accedi alla banca dati:
Antibodypedia

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