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Un algoritmo scova le alterazioni genomiche del cancro.

Posted by giorgiobertin su maggio 26, 2016

I ricercatori dell’Eli and Edythe Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, Massachusetts, USA, hanno sviluppato un algoritmo informatico denominato “REVEALER” per scoprire alterazioni genomiche complementari connesse al cancro.

Il cancro è raramente il risultato di una singola mutazione in un singolo gene, piuttosto, i tumori derivano dalla complessa interazione tra un qualsiasi numero di variazioni anomale presenti nel genoma, le combinazioni di queste anomalie possono essere univoche per ogni singolo paziente.

gene-pattern

REVEALER è stato progettato per aiutare i ricercatori ad identificare i gruppi di variazioni genetiche che associate assieme attivano le cellule tumorali, e come queste rispondono a determinati trattamenti. REVEALER è disponibile free per la comunità, scientifica attraverso il portale: GenePattern.org.

Leggi abstract dell’articolo:
Characterizing genomic alterations in cancer by complementary functional associations
Jong Wook Kim, Olga B Botvinnik,Omar Abudayyeh,Chet Birger,Joseph Rosenbluh, Yashaswi Shrestha,Mohamed E Abazeed + al.
Nature Biotechnology Published online 18 April 2016 doi:10.1038/nbt.3527

GenePattern.org.

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